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    转录因子结合位点识别问题的算法研究  CNKI文献

    转录是基因表达的第一阶段,也是基因调节的主要阶段,通过转录因子与特异的DNA序列结合,对基因的表达起抑制或增强的作用。识别DNA序列的中的这些结合区域,即转录因子结合位点识别,对了解基因的转录活性及理解基因...

    张懿璞 导师:霍红卫 西安电子科技大学 2014-04-01 博士论文

    关键词: 转录因子结合位点 / 模体发现 / 期望最大化 / 染色体免疫共沉淀测序

    下载(695)| 被引(10)

    用于转录因子结合位点识别的定位投影求精算法  CNKI文献

    定位转录因子结合位点,也称模体发现问题,对于理解基因调控关系非常重要.文中提出了一种新的定位投影求精算法(Fixed-Position Projection Refinement algorithm,FPPR)用于DNA序列中的转录因子结合位点识别.通过一个基...

    张懿璞 霍红卫... 《计算机学报》 2013年12期 期刊

    关键词: 转录因子结合位点 / 模体 / 定位投影 / 求精

    下载(116)| 被引(6)

    (l,d)-模体识别问题的遗传优化算法  CNKI文献

    转录因子结合位点识别在基因表达调控过程中起着重要的作用.文中提出了一种贝叶斯模型驱动的模体识别的遗传优化算法GOBMD(Genetic Optimization with Bayesian Model for Motif Discovery).GOBMD首先使用一个基于位置...

    霍红卫 郭丹丹... 《计算机学报》 2012年07期 期刊

    关键词: 模体识别 / 遗传算法 / 贝叶斯模型 / 散列

    下载(248)| 被引(11)

    基于MapReduce的模体发现算法  CNKI文献

    模体发现对于基因发现和理解基因调控关系有着重要的意义,它是生物信息学中最具挑战性的问题之一。提出了针对PMSP算法的3种数据划分方法,并在此基础上提出了基于MapReduce的模体发现算法(PMSPMR)。针对不同难度的问题...

    霍红卫 林帅... 《中国科技论文》 2012年07期 期刊

    关键词: 模体发现 / 数据划分 / 可扩展性

    下载(117)| 被引(6)

    一种新的DNA模体发现聚类求精算法  CNKI文献

    模体发现问题是分析基因转录调控关系的一个重要方面.提出了一种新的基于熵的聚类求精算法——ECRmotif,用于DNA序列中的模体发现问题.ECRmotif使用灵活的概率模型从背景序列中鉴别模体.它首先使用一个基于熵的聚类过...

    张懿璞 《西安电子科技大学学报》 2014年06期 期刊

    关键词: 模体发现 / 聚类 / 求精

    下载(66)| 被引(1)

    基于广义自相关的盲信号分离  CNKI文献

    近几十年来,盲信号分离因为它在多种问题上的应用潜力受到广大研究者的重视。一般来说,盲信号分离包括盲信号并行分离和盲信号提取两种方法。所谓盲信号并行分离就是同时恢复线性混合中的独立成分,同时分离出所有的独...

    张懿璞 导师:冶继民 西安电子科技大学 2010-01-01 硕士论文

    关键词: 盲提取 / 自相关 / 独立成分分析

    下载(155)| 被引(1)

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