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    CNKI为你找到相关结果

    用于转录因子结合位点识别的定位投影求精算法  CNKI文献

    定位转录因子结合位点,也称模体发现问题,对于理解基因调控关系非常重要.文中提出了一种新的定位投影求精算法(Fixed-Position Projection Refinement algorithm,FPPR)用于DNA序列中的转录因子结合位点识别.通过一个基...

    张懿璞 霍红卫... 《计算机学报》 2013年12期 期刊

    关键词: 转录因子结合位点 / 模体 / 定位投影 / 求精

    下载(116)| 被引(6)

    高阶熵压缩的全文自索引  CNKI文献

    大数据集正在以前所未有的速度产生,研制大数据集的实用压缩全文自索引是目前的挑战问题之一.该文提出了一种高阶熵压缩的全文自索引.对于长为n的文本T以及任意k≤clog_σn-1和c<1,该压缩索引占用2nH_k(T)+n+o(n)位...

    霍红卫 陈晓阳... 《计算机学报》 2016年12期 期刊

    关键词: 大数据 / 压缩索引 / 自索引 / 高阶熵

    下载(177)| 被引(1)

    一组提高存储效率的深度包检测算法  CNKI文献

    随着深度包检测规则数目的剧烈增长,为了适应网络处理的需求,必须对表示正则表达式的DFA(deterministic finite automata,确定的有限自动机)进行高效的存储.一方面,对DFA的状态点数目进行压缩,提出了一种复合的FSM(有...

    于强 霍红卫 《软件学报》 2011年01期 期刊

    关键词: 深度包检测 / 正则表达式 / 多模式匹配 / 复合的FSM

    下载(339)| 被引(26)

    (l,d)-模体识别问题的遗传优化算法  CNKI文献

    转录因子结合位点识别在基因表达调控过程中起着重要的作用.文中提出了一种贝叶斯模型驱动的模体识别的遗传优化算法GOBMD(Genetic Optimization with Bayesian Model for Motif Discovery).GOBMD首先使用一个基于位置...

    霍红卫 郭丹丹... 《计算机学报》 2012年07期 期刊

    关键词: 模体识别 / 遗传算法 / 贝叶斯模型 / 散列

    下载(248)| 被引(11)

    基于最大权值路径算法的DNA多序列比对方法  CNKI文献

    针对生物序列分析中的多序列比对问题,当输入数据量比较大时,人们提出了很多启发式的算法来改善计算速度和比对结果.提出了用于进行全局DNA多序列比对的一种方法:MWPAlign(maximum weighted path alignment).该算法把...

    霍红卫 肖智伟 《软件学报》 2007年02期 期刊

    关键词: 多序列比对 / deBruijn图 / 调和序列 / 最大权值路径

    下载(584)| 被引(25)

    入侵检测系统概述  CNKI文献

    该文首先介绍了入侵检测系统的发展过程,接着阐述了入侵检测系统的功能、模型、分类,并在入侵检测系统的结构和标准化上做了深入的探讨。然后详细研究了入侵检测系统的检测技术,最后指出了目前入侵检测系统中存在的问...

    张超 霍红卫... 《计算机工程与应用》 2004年03期 期刊

    关键词: 防火墙 / 入侵检测 / 入侵检测系统 / CIDF

    下载(665)| 被引(107)

    SegHMC:一种基于Segmental HMM模型的顺式调控模块识别算法  CNKI文献

    顺式调控模块(Cis-regulatory module,CRM)在真核生物基因的转录调控中起着重要作用,识别顺式调控模块是当前计算生物学的一个重要课题.虽然当前有许多计算方法用于识别顺式调控模块,但识别准确率仍有待进一步提高.将...

    郭海涛 霍红卫... 《自动化学报》 2016年11期 期刊

    关键词: 基因的转录调控 / 模体 / Segmental / HMM

    下载(92)| 被引(1)

    快速排序算法研究  CNKI文献

    排序是计算机科学中最重要的研究问题之一。2000年被列为20世纪对科学和工程计算的研究与实践影响最大的10大问题之一。文章介绍了基本的快速排序算法及三种枢轴元素的选取方法,全面深入地分析了快速排序算法最坏情况...

    霍红卫 许进 《微电子学与计算机》 2002年06期 期刊

    关键词: 快速排序 / 时间复杂度 / 枢轴元素 / 比较

    下载(1486)| 被引(49)

    自适应蚁群算法在序列比对中的应用  CNKI文献

    序列比对是生物信息学的重要研究工具。蚁群算法是一种新型的模拟进化算法 ,并被成功地应用于旅行商问题 (TSP)等组合优化问题中。该文将蚁群算法应用于序列比对 ,并提出基于自适应调整信息素的改进算法。仿真结果表明...

    梁栋 霍红卫 《计算机仿真》 2005年01期 期刊

    关键词: 蚁群算法 / 序列比对 / 信息素

    下载(427)| 被引(40)

    DNA序列中基于适应性后缀树的重复体识别算法  CNKI文献

    现有的在DNA序列中识别重复体的算法多数是基于比对的,对识别速度和吞吐量有很大的限制.针对这个问题文中根据一个平衡重复体的长度和频率的定义,提出了一种基于Ukkonen后缀树的快速识别重复体的RepSeeker算法.算法采...

    霍红卫 王小武 《计算机学报》 2010年04期 期刊

    关键词: 重复体识别 / 适应性后缀树 / Ukkonen算法 / RepSeeker算法

    下载(232)| 被引(9)

    遗传算法在图论和优化中的应用  CNKI文献

    图论和优化中的许多问题是NP-完全问题,也是科学和工程计算中重要和基本的 问题。将遗传算法与启发式算法、邻近搜索方法结合解决这类问题,是遗传算法的主 要研究领域之一。本文对遗传算法的基...

    霍红卫 导师:保铮 西安电子科技大学 2000-01-01 博士论文

    关键词: 遗传算法 / 图论 / 优化 / 启发式算法

    下载(1999)| 被引(9)

    选择和变异算子的作用分析  CNKI文献

    文中在连续空间统一的随机过程框架下 ,分析了遗传算法群体的概率密度序列的演化过程 ,给出并证明了群体概率密度的递归公式 .分析了标准遗传算法中选择算子和变异算子的基本性质 .导出了选择和变异条件下平均适应度单...

    霍红卫 许进... 《电子学报》 2000年02期 期刊

    关键词: 遗传算法 / 连续空间 / 选择算子 / 变异算子

    下载(453)| 被引(30)

    基于遗传算法的0/1背包问题求解  CNKI文献

    利用遗传算法提出了解决0/1背包问题的3种算法.这3种算法分别是基于罚函数修正方法和译码方法的算法.理论分析表明,修正方法可以获得问题的最优解.在不同测试数据集上对这3种算法的性能进行了比较,结果与理...

    霍红卫 许进... 《西安电子科技大学学报》 1999年04期 期刊

    关键词: 遗传算法 / 0/1背包 / 数据集

    下载(670)| 被引(40)

    典型并行算法的实现性能分析  CNKI文献

    讨论和分析了几种典型的并行算法及其各种处理方法在基于WindowsXP环境、消息传递接口MPI并行编程环境支持和C++语言描述的编程实现问题,给出了相应并行程序详尽的计算结果,对比分析了它们的计算性能,以及它们对计算精...

    雷英杰 霍红卫 《空军工程大学学报(自然科学版)》 2003年05期 期刊

    关键词: 并行计算 / 消息传递接口 / 并行算法 / 高性能计算

    下载(229)| 被引(24)

    基于MapReduce的模体发现算法  CNKI文献

    模体发现对于基因发现和理解基因调控关系有着重要的意义,它是生物信息学中最具挑战性的问题之一。提出了针对PMSP算法的3种数据划分方法,并在此基础上提出了基于MapReduce的模体发现算法(PMSPMR)。针对不同难度的问题...

    霍红卫 林帅... 《中国科技论文》 2012年07期 期刊

    关键词: 模体发现 / 数据划分 / 可扩展性

    下载(117)| 被引(6)

    分组遗传算法用于图的着色  CNKI文献

    图的着色算法是一种典型的NP 完全问题 在系统地讨论了图的正常顶点着色、边着色以及全着色的有关理论的基础上 ,提出了基于分组遗传算法和启发式搜索的图的正常 k 点着色 ,正常k 边着色以及正常k 全着色的新型混合算...

    霍红卫 许进... 《西北民族学院学报(自然科学版)》 2000年01期 期刊

    关键词: 分组遗传算法 / 图的着色 / NP-完全问题

    下载(257)| 被引(15)

    基于K-D树的多维数据分布方法  CNKI文献

    系统地介绍了基于并行化k-d树的多维数据分布方法。给出了几种构造k-d树的策 略和相应算法,并从理论上分析和比较了各种策略的通信花费及其应用范围。

    王碧 霍红卫 《计算机工程》 2003年03期 期刊

    关键词: 并行数据库 / 数据分布 / k-d树 / 基于排序的方法

    下载(381)| 被引(15)

    多序列比对问题的粒子群优化算法求解  CNKI文献

    文章提出了一新的算法,利用粒子群优化算法求解多序列比对的问题,这是粒子群优化算法在生物信息学方面的一个新的应用。文章从粒子群算法的原理和多序列比对问题模型入手,来提出怎样改造粒子群优化算法使其可以解决多...

    张鹏帅 霍红卫 《计算机工程与应用》 2005年18期 期刊

    关键词: 生物信息学 / 双序列比对 / 多序列比对 / 粒子群优化算法

    下载(300)| 被引(9)

    生物序列模体的混合Gibbs抽样识别算法  CNKI文献

    针对生物序列模体的识别问题,提出了一个新的混合Gibbs抽样识别算法.算法基于混合模体模型学习,采用贪心策略,通过似然度最大化,逐次将新的模体加入到混合模型中.算法中设计了位点抽样和模体抽样两种抽样方法,这两种抽...

    刘立芳 霍红卫... 《电子学报》 2008年04期 期刊

    关键词: 生物信息学 / 模体识别 / Gibbs抽样 / 混合模体模型

    下载(216)| 被引(4)

    一种具有精确边界的重复体识别算法  CNKI文献

    当前大部分重复体识别算法不是依靠于已经标识的重复体数据库就是定义重复体为两个最大长度的相似序列,而没有一个严格的定义来平衡重复体的长度和频率.针对这些问题文中提出了一种基于局部序列比对算法BLAST变型且支...

    霍红卫 白帆 《计算机学报》 2008年02期 期刊

    关键词: 调和序列 / 重复体识别 / 精确边界 / BLAST

    下载(178)| 被引(3)

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